通話するグループごとに接続できるユーザーを設定できますか？

はい、できます。例えば、以下のように、店舗ごとに通話するグループを分けることができます。

（1）グループ店舗A 店舗Aのユーザーのみ、接続できるグループ
（2）グループ店舗B 店舗Bのユーザーのみ、接続できるグループ
（3）グループ全員全ユーザーが、接続できるグループ